Естественно-научная траектория ориентирует на такие сферы деятельности, как медицина, биотехнологии и др. В основу учебного плана положен вариант федерального учебного плана универсального профиля при шестидневной учебной неделе.
Учебный план естественно-научного профиля обучения включает 13 учебных предметов («Русский язык», «Литература», «Иностранный язык», «Математика», «Информатика», «История», «Обществознание», «География», «Физика», «Химия», «Биология», «Физическая культура», «Основы безопасности жизнедеятельности») и 2 учебных предмета на углубленном уровне: «Химия» и «Биология» из предметной области «Естественно-научные предметы».
В учебном плане учебный предмет «Математика» (предметная область «Математика и информатика») представлен в виде трех учебных курсов: «Алгебра и начала математического анализа», «Геометрия», «Вероятность и статистика».
Учебный план профиля строится с ориентацией на будущую сферу профессиональной деятельности, с учетом предполагаемого продолжения образования обучающихся.
Часть, формируемая участниками образовательных отношений, представлена следующими элективными курсами:
- Изучение трудных вопросов химии (10 класс)
- Изучение трудных вопросов биологии (10 класс)
- Прикладная генетика ( 11 класс)
- Решение задач по химии повышенной сложности (11 класс)
С целью развития познавательного интереса к родному краю в 10-11х классах за счет части, формируемой участниками образовательных отношений, увеличено учебное время для изучени предмета «История» на 0,5 часа. Данное учебное врем использовано дл интеграции в данный предмет тем курса «История Ставрополья».
Для расширения знаний по искусству, развития общей культуры личности в части, формируемой участниками образовательных отношений, выделен 1 час в 10 и 11 классах на изучение курса «Мировая художественная культура».
С целью удовлетворения потребностей обучающихся на изучение родного зыка как инструмента познания национальной культуры и самореализации в ней, развития познавательного интереса к родному зыку, а через него к родной культуре введен элективный курс «Русский родной язык».